喜欢魔术的高中生黑羽快斗,偶然发现了藏在自己房间里的密室.这个密室是他的父亲──世界知名的魔术家黑羽盗一,在8年前一次事故中神秘死去前所使用的.密室中存放著8年前消失的神秘大盗怪盗奇度的装备和服装.黑羽快斗穿上怪盗奇度的服装,并与父亲多年前的助手,如今正在假扮怪盗奇度的寺井黄之助相遇,才知晓自己的父亲当年是死于谋杀.为了揭开父亲的死因,黑羽快斗决定继承父亲怪盗奇度的身份,并且调查父亲的死因.在调查的时候,黑羽快斗偶然和一支称他为"黑羽盗一"的神秘组织相遇.原来这个组织,为了寻找一种可以带来长生不老的神秘宝石命运之石"潘朵拉",而将妨碍到他们的黑羽盗一杀死.快斗因此开始了与神秘组织的交锋,试图阻止他们的野心.